Od školského roku 2018/2019 je organizačnou zložkou SŠI je Špeciálna základná škola internátna so sídlom na Partizánskej 1057 v Snine.

Špeciálna základná škola zabezpečuje výchovu a vzdelanie žiakov so špecialnými výchovno-vzdelávacimi potrebami, ktorí sa pre svoje postihnutie nemôžu bez špeciálneho prístupu s úspechom vzdelávať v bežnej základnej škole.